La commune de Merxheim fait partie de plusieurs structures intercommunales :
La communauté de communes de la région de Guebwiller (CCRG)
Depuis le 1er janvier 2012, la commune de Merxheim fait partie de la Communauté de communes de la région de Guebwiller dont elle devient le dix-septième membre.
Lien direct : CCRG
SIVOM - Syndicat Intercommunal à Vocation Multiple de Rouffach
Le SIVOM de Rouffach se compose des 8 communes du canton de Rouffach (Gueberschwihr, Gundolsheim, Hattstatt, Osenbach, Pfaffenheim, Rouffach, Soultzmatt, Westhalten) et de Merxheim.
Il exerce les compétences suivantes :
- les travaux et équipements du COSEC
- soutien financier au Collège Jean-Moulin
- soutien aux initiatives en direction des jeunes collégiens
Président :
- Nathalie LALLEMAND, Maire de Westhalten
Vice président :
- Jean Pierre TOUCAS, Maire de Rouffach
Le PETR (Pôle d'Equilibre Territorial et Rural) remplace le Pays Rhin Vignoble Grand Ballon
Merxheim fait partie du PETR du Pays Rhin vignoble Grand Ballon qui regroupe toutes les communes de :
- la communauté de Communes Centre Haut-Rhin (9 communes)
- la communauté de Communes du pays Rhin-Brisach (22 communes)
- la communauté de Communes de la Région de Guebwiller (19 communes)
Le pays dispose de son propre site internet : rhin-vignoble-grandballon.fr